В 19 лет преподобный отправился на Валаам, в 26 был пострижен в монахи с именем Александр и подвизался еще 11 лет в монастыре из них 7 лет провел в уединении на одном из островов Валаама, ныне называемом Святым. Там преподобный Александр получил откровение о том, что ему надлежит вернуться в родные места и там послужить Богу. В 37 лет игумен Валаамского монастыря после испытания благословил преподобного Александра вернуться на реку Свирь. Там преподобный еще 7 лет провел в полном уединении, питавшись травой и даже землей, тяжело болел, испытывал нападения злых духов, прежде чем по Промыслу Божиему его уединение было открыто боярину Андреем Завалишиным. Преподобному Александру во время этой встречи было 44 года. Через Андрея Завалишина о преподобном Александре узнали и он уже не мог утаиться от внимания людей. Постепенно вокруг преподобного собралась братия и сам он дважды удостоился посещения ангела, который возвещал ему о том, что он будет водителем братии ко Христу. Однако, преподобный Александр ужасался своего недостоинства перед трудностями сего пути, так отличного от любимого им уединенного жития. Но в 1507-м году, в возрасте 59 лет преподобный сподобился явления и беседы со Святой Троицей, явно повелевшей ему возглавить братию, устроить обитель и воздвигнуть храм в честь Святой Троицы. Место явления Святой Троицы отмечено часовней на территории Преображенской части Александро-Свирского монастыря. Благодаря монаху Иродиону, подробно записавшему житие преподобного Александра, мы дословно знаем содержание второй беседы человека и Триединого Бога после более чем 3000-летнего перерыва.
Преподобный Александр Свирский исполнил данное ему повеление. В 1508 году принял священнический сан и построил деревянную Троицкую церковь, а в 1526 году был построен каменный Троицкий храм. Этот храм не сохранился в том виде в каком он был построен. На его месте ныне стоит большой Троицкий собор, построенный в 1695-1697 г. Самой древней сохранившейся постройкой монастыря является небольшая, изящная церковь Покрова Пресвятой Богородицы (1533-1535), к которой были пристроены обширные трапезные палаты с кухней. Эта церковь была "зимней" т. е. отапливаемой. Под алтарной частью церкви Покрова Пресвятой Богородицы находится доступное для паломников место над которым Богородица явилась преподобному Александру в начале постройки церкви и благословила сие место своим заступничеством на все время. Вскоре после начала постройки церкви Покрова, преподобный Александр Свирский отошел ко Господу в возрасте 85-ти лет, 30 августа 1533 года. Всего через 14 лет, в 1547 году, Александр Свирский был прославлен как преподобный, а в 1641-м году, при строительстве каменного Преображенского храма, были обретены его нетленные мощи.
Обитель преподобного Александра знала периоды расцвета, когда ее именовали Северной Лаврой и периоды запустения, однако заступничеством Пресвятой Богородицы сохранилась до наших дней с незначительными потерями. Из 8-ми церквей обители ныне существуют семь. В 1918-м году обитель была закрыта, а святые мощи преподобного Александра Свирского, казалось утрачены безвозвратно. Но в 1998-м году они были второй раз обретены в стенах Санкт-Петербургской Военно-Медицинской академии. С возвращения мощей преподобного Александра Свирского в свою обитель, началась новая страница в ее истории, под незримым духовным водительством святого основателя тайнозрителя Святой Троицы.
Подобно преподобному Сергию Радонежскому, многие ученики Преподобного Александра Свирского стали основателями монастырей. Например, упомянутый выше, боярин Андрей Завалишин стал основателем Ондрусовской пустыни. Свирский старец Леонид стал впоследствии знаменитым преподобным Львом Оптинским - основоположником старчества в Оптиной пустыни. В монастырь в 1827 году поступил послушником будущий святитель Игнатий Брянчанинов.